Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2536624	2536695	72	63 [1]	[0] 35	rfaS	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

ATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAATATTAA  >  minE/2536558‑2536627                                                                  |     aTGCCATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:52404/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACGAATATTAAAAAata      >  1:1556301/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAatataga  >  1:1176643/1‑67 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:438913/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:555718/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:552896/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:547510/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:534976/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:5013/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:444482/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:562896/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:4079/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:40754/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:365867/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:317343/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:31223/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:310055/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:556496/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:243380/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:569942/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:576721/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:602401/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:637183/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:765870/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:779993/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:827915/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:833387/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:875247/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:915998/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:950173/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:974600/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:979623/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:983524/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1222877/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1002758/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1004781/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1029612/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1048319/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1049968/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1078854/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1107531/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1123223/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1126686/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1149923/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:116202/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1163577/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1173289/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:118169/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:249912/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1230961/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1242860/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:12778/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1297140/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1320248/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1329414/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1390058/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1400847/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1455727/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:147883/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:152151/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:159017/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:167574/1‑66 (MQ=255) aTGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAata      >  1:1000512/1‑66 (MQ=255)                                                                  |     ATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAATAAAGGTATCAATAAACAAATATTAAAAAATATTAA  >  minE/2536558‑2536627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑