Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2540914	2540927	14	36 [0]	[0] 44	rfaY	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

ACGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGA  >  minE/2540845‑2540913                                                                     | aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:56951/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:298000/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:319932/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:369411/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:412877/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:429892/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:471935/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:481736/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:551545/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:279469/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:569603/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:613925/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:661745/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:666479/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:673664/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:718853/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:878335/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:958557/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1280259/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1052548/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1090030/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1109607/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1166993/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1168549/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1197402/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1264004/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1265218/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1289381/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1474585/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1474896/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1530653/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:173582/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:198542/69‑1 (MQ=255) aCGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:226519/69‑1 (MQ=255)  cGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:1375915/68‑1 (MQ=255)                ttATATCATTATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGa  <  1:104893/54‑1 (MQ=255)                                                                     | ACGTTTTGTCCATACTTATATCATGATCATCGAGTATATTGATGGCATAGAGTTGTGTGATATGCCCGA  >  minE/2540845‑2540913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑