Missing coverage evidence...
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CCGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTA  >  minE/2589339‑2589409                                                                       | ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATGCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:900250/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1550687/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:843773/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:841076/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:835277/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:758682/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:518369/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:271108/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1458630/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1254597/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1225588/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1168236/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:116059/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1138434/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:907826/71‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTAACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:525228/71‑1 (MQ=255)  cGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:16766/70‑1 (MQ=255)  cGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:860377/70‑1 (MQ=255)  cGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1005219/70‑1 (MQ=255)  cGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:1224772/70‑1 (MQ=255)        cGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTa  <  1:107626/64‑1 (MQ=255)                                                                       | CCGTTATCGTTTCGAATATGTCATCCTTTTCATTATTTACATCCTTGTCCGAATCGTTGTTCAATATAGTA  >  minE/2589339‑2589409

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑