Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2611752	2611867	116	56 [0]	[1] 38	nikB	nickel transporter subunit

CCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTGG  >  minE/2611681‑2611751                                                                       | ccGGGCGTTGGCTGGCTAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:361125/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:651550/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1452698/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1458226/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1545742/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:184060/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:27842/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:440061/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:540732/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:583584/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:590037/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:648284/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1030617/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:652834/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:66064/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:670494/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:673305/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:697533/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:738649/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:785039/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:876218/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:957174/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:977783/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1449532/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1134285/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1170822/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1213148/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1216329/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1082991/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1261624/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1262922/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1314021/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1322785/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1343533/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:134716/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1076356/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1032000/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1384051/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1016975/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGGCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:235210/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGGCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:695278/71‑1 (MQ=255) ccGGGCGTGGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:599118/71‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:774387/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:791027/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1397009/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1242854/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1485521/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTAAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:234749/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACAAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1252806/70‑1 (MQ=255)  cGGGCGGTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACACCCAGGTGCCGTACTgg  <  1:733497/70‑1 (MQ=255)   gggCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1370634/69‑1 (MQ=255)                              aaGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:226014/42‑1 (MQ=255)                                gTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:52497/40‑1 (MQ=255)                                 tCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1059739/39‑1 (MQ=255)                                  cAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:1095098/38‑1 (MQ=255)                                   aaGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTgg  <  1:970056/37‑1 (MQ=255)                                                                       | CCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGCAGCGCCTTCCACAACCAGGTGCCGTACTGG  >  minE/2611681‑2611751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑