Missing coverage evidence...
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ATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAC  >  minE/2617169‑2617238                                                                      | atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1488892/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:535714/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:517208/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:493741/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:459737/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:455556/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:680053/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:713694/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:342222/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:749705/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:177934/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:766464/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:787647/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1445217/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1437137/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:141121/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:907255/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1350745/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1263008/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1201254/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1031473/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1088126/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1048186/70‑1 (MQ=255) atcatcACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1046249/70‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:907433/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:84123/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:630267/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:548896/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:371603/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:368853/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1478793/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:143338/69‑1 (MQ=255)  tcatcaCAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1364443/69‑1 (MQ=255)              ggaaGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:208811/55‑1 (MQ=255)                      cATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1143275/49‑1 (MQ=255)                        tAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCTCATTGAc  <  1:499402/47‑1 (MQ=255)                        tAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:1557040/47‑1 (MQ=255)                               cagGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:619879/40‑1 (MQ=255)                                  gCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAc  <  1:423402/37‑1 (MQ=255)                                                                      | ATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATTGAC  >  minE/2617169‑2617238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑