Missing coverage evidence...
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CGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGC  >  minE/2624282‑2624352                                                                       | cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:638512/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:278451/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:294100/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:313515/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:416045/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:49207/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:518280/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:554905/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:560403/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:569992/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:582308/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:268075/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:644833/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:675691/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:724918/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:735169/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:73610/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:74591/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:877758/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:965754/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:991308/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1267652/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1049975/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:108564/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:109318/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1099223/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1119856/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1174458/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1194177/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1229347/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1021292/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1270391/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1284279/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1394900/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:143027/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1452627/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1506703/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1556355/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:187419/71‑1 (MQ=255) cGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:222964/71‑1 (MQ=255)           cggcacggcGAAAGTCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1259685/61‑1 (MQ=255)                             ggTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGc  <  1:1160749/43‑1 (MQ=255)                                                                       | CGAAACTGGACGGCACGGCGAAAGGCGGGGTAATTTTCTCGGTGGCTGACCAGTTTGGTATCCCTATCCGC  >  minE/2624282‑2624352

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑