Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662640	2662721	82	22 [0]	[0] 32	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

TTATGCAGTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGC  >  minE/2662587‑2662639                                                     | ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:308678/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:980761/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:934390/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:78710/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:723208/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:680347/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:642424/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:641634/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:434201/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:390970/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:31992/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:1007170/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:292845/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:267098/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:257330/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:250515/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:208907/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:1460772/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:139736/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:133157/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:1176484/53‑1 (MQ=255) ttATGCATTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGc  <  1:1144577/53‑1 (MQ=255)                                                     | TTATGCAGTTCAATCTCAACGCTCACCACTTCTGTTTCTGGCGAAACGCTGGC  >  minE/2662587‑2662639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑