Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2689212	2689689	478	46 [0]	[0] 55	yhgE	predicted inner membrane protein

TCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGTTTATT  >  minE/2689168‑2689211                                            | tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttgtt  <  1:666587/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:595099/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:328934/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:339469/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:34483/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:436033/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:4418/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:449536/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:492717/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:548409/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:553816/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:558453/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:574816/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:304658/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:603827/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:654102/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:741816/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:751608/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:836909/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:892274/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:921325/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:942407/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:95131/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1523543/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1043571/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1059963/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1176975/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1304251/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1312449/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1399247/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1411906/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1505260/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1522185/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1035250/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1548397/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1548946/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:165242/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:179651/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:230469/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:233917/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:24566/44‑1 (MQ=255) tCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:2596/44‑1 (MQ=255)  cACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1474538/43‑1 (MQ=255)   aCGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:232696/42‑1 (MQ=255)       ttttCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGtttatt  <  1:1519019/38‑1 (MQ=255)         ttCAATCCGCTCTTTTTTGCAACCGCCTGGtttatt  <  1:282704/36‑1 (MQ=37)                                            | TCACGTTTTTCAATACGCTCTTTTTTGCAACCGACTGGTTTATT  >  minE/2689168‑2689211

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑