Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2753908	2754340	433	52 [0]	[0] 22	[mscL]–[trkA]	[mscL],[trkA]

AATAAGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACAA  >  minE/2753859‑2753907                                                 | aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:433027/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:758095/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:150173/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1007628/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1529558/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1531989/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:167648/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:236337/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:247923/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:280398/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:351889/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:365483/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1486768/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:447875/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:468242/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:545330/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:549953/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:556922/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:581748/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:626929/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:725099/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:731690/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:732670/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1193660/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:990149/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1034546/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1075632/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1076236/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1085521/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:943104/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1130130/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:840610/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1159452/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1163086/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1186753/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1195313/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1265944/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1277511/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1358604/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1397441/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:768374/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1453199/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1460148/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1461825/49‑1 (MQ=255) aataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1482983/49‑1 (MQ=255)  ataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1523441/48‑1 (MQ=255)  ataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1416720/48‑1 (MQ=255)  ataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1144354/48‑1 (MQ=255)  ataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:112221/48‑1 (MQ=255)  ataaGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:1022641/48‑1 (MQ=255)       cccAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:859835/43‑1 (MQ=255)            aggaggCATGTTGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACaa  <  1:149857/38‑1 (MQ=255)                                                 | AATAAGCCCAGAGGAGGCATGATGATATCGGCAACCAGTGAAGAGACAA  >  minE/2753859‑2753907

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑