Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2777297	2777348	52	66 [0]	[0] 133	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

CTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAATTCTTTTTCT  >  minE/2777226‑2777296                                                                       | cTATACGGTTTTGGTGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1314458/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATGACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1416427/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:562373/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:621884/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:619547/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:607902/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:601839/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:598836/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:57392/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:653771/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:533390/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:506854/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:499095/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:495215/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:483289/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:466166/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:465636/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:647394/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:459021/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:668930/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:693264/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:701729/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:761980/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:769120/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:793886/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:82047/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:822168/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:834308/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:879358/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:915067/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:935319/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:995702/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1501002/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1058210/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1117946/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1165951/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1169654/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1193020/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1198345/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1271435/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1300916/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1404590/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1424624/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1469048/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:448981/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:17387/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:260405/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:447873/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:447749/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:367545/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:341890/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:336539/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:318505/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:270458/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:204435/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGGGTCGCCCAGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1102227/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGGCGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1533265/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTTGCGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:469532/71‑1 (MQ=255) cTATACGGTTTAGGGGGCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:288592/71‑1 (MQ=255)         ttttGGGGTCGCGCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:429408/63‑1 (MQ=255)           ttGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:7575/61‑1 (MQ=255)             ggggTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:140904/59‑1 (MQ=255)             ggggTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:467637/59‑1 (MQ=255)                 tCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1389791/55‑1 (MQ=255)                   gCCCCGGAAAATAACTTTGACCATTTAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1193890/53‑1 (MQ=255)                                    agACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAAttctttttct  <  1:1050028/35‑1 (MQ=255)                                                                       | CTATACGGTTTTGGGGTCGCCCCGGAAAATAACATTGACCATTAAGTTTAATTCTTGGGAATTCTTTTTCT  >  minE/2777226‑2777296

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑