Missing coverage evidence...
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TTGTATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCA  >  minE/2859941‑2860011                                                                       | ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:246326/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:837589/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:792303/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:780978/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:740521/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:675090/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:669607/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:593906/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:522859/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:416996/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:117602/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:212579/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:150556/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1358705/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1350601/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1293244/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1290484/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1287945/1‑71 (MQ=255) ttgtATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCa  >  1:1187493/1‑71 (MQ=255)                                                                       | TTGTATCTGGAGATCGACCCACATCAGGTGGACGTCAACGTGCACCCCGCCAAACACGAAGTGCGTTTCCA  >  minE/2859941‑2860011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑