Missing coverage evidence...
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TGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGC  >  minE/2881951‑2881994                                            | tgggcttTTGCCGGATTATGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1200883/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:56005/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:379385/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:43769/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:44255/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:449303/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:45736/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:505056/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:54916/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:553550/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:359462/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:685932/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:688788/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:693789/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:73417/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:738172/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:811551/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:995192/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1274277/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1057649/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1076813/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1211969/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1213743/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1218384/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1247143/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1259915/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1340418/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1437934/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1471291/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:198385/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:205849/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:246269/44‑1 (MQ=255) tgggcttTTGCCGGA‑TACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:733963/43‑1 (MQ=38)  gggcttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1434067/43‑1 (MQ=255)     cttTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc  <  1:1056801/40‑1 (MQ=255)                                            | TGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGC  >  minE/2881951‑2881994

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑