Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2887325	2887518	194	55 [0]	[0] 34	ytfJ/ytfK	predicted transcriptional regulator/conserved hypothetical protein

CATCATCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGATA  >  minE/2887254‑2887324                                                                       | catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:590717/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:230926/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:257870/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:274344/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:391310/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:447913/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:449316/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:450762/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:457294/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:49666/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:499585/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:503750/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:541984/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:578776/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:21291/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:595351/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:661170/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:733357/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:744303/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:74680/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:76605/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:856971/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:86914/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:910376/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:920713/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:938619/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:962185/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:96758/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1331171/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1062703/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1064699/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1071601/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1096097/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1101657/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1116481/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1117903/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1119400/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1150154/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:116020/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:117544/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1289809/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1291658/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1005559/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1348781/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1398026/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1399925/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1451370/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1455784/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1490744/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1503543/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1515438/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1532045/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1540235/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:1540595/1‑71 (MQ=255) catcatCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGata  >  1:17026/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CATCATCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGATA  >  minE/2887254‑2887324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑