Missing coverage evidence...
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GGTTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCG  >  minE/231007‑231077                                                                       | ggtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:336363/71‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:329783/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:932391/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:69351/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:560090/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:526300/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:519370/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:514214/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:468873/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:467234/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:463586/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:360985/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:346945/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1022923/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:16590/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1485260/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1442771/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1429792/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1363630/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1255367/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:121110/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:118281/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1165103/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1068235/70‑1 (MQ=255)  gtTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1063266/70‑1 (MQ=255)  ggtGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:65595/68‑1 (MQ=255)      cTGTTAAAGCTGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1419157/66‑1 (MQ=255)                              aTGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCg  <  1:1181616/42‑1 (MQ=255)                                                                       | GGTTGCTGTTAAAGCCGAAGAGTATGACGATGAGTTTCTGTCATTAGATTTGAACGTCAAAATCGTCAGCG  >  minE/231007‑231077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑