Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 269388 269579 192 145 [0] [0] 162 [ispA]–[xseB] [ispA],[xseB]

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

TCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTG  >  minE/269580‑269650
|                                                                      
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTTGGCttg  <  1:199728/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCTGCttg  <  1:764097/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:537630/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:700672/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:698035/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:6933/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:684293/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:68373/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:64884/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:606511/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:598375/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:586604/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:573032/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:544613/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:710002/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:527940/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:510152/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:482282/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:480107/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:473608/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:46730/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:42729/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:414878/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:407060/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:39532/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1006068/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:861939/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:997591/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:970730/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:966021/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:963962/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:963875/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:956679/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:938873/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:922567/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:909559/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:905563/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:876090/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:391604/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:853715/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:853714/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:829020/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:82663/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:817881/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:817660/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:781235/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:77285/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:756849/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:736552/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:723017/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1177552/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1350455/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:366573/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1329654/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1324426/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1323868/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1289356/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1284744/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1229029/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:120627/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1206182/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1203183/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:134302/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1171154/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1142457/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1141923/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1120303/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1089755/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1072924/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1072046/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:106771/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1045508/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1040718/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1027693/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1380118/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:354265/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:338503/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:316464/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:284581/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:2704/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:235780/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:220149/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:178562/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:177331/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:17004/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:162734/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:157966/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1543999/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1525928/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1507849/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1491768/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1455679/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1416520/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1407783/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1392595/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1381271/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1356883/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGGCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:969224/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGGCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:867354/71‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGAGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCttg  <  1:1087897/71‑1 (MQ=255)
|                                                                      
TCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTG  >  minE/269580‑269650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑