Missing coverage evidence...
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TTGTTATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATG  >  minE/306785‑306855 |                                                                       ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:742150/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:266139/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:372679/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:463291/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:465156/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:485315/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:603287/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:649571/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:654158/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:722490/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:240034/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:790488/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:799518/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:848616/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:889879/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:899588/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:900537/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:914815/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:969719/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:98715/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:138860/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1069666/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1104256/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1204270/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1212020/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1248265/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1347766/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1353221/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1364127/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1369427/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1021839/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1403944/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1431978/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1495871/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1502062/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1520424/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1522442/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:1558921/71‑1 (MQ=255) ttgttATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATg  <  1:220842/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TTGTTATCGATATAAGCCACTTCCTGAATATAGCGATAACTGTAAGATACCCGACGCATTTCCATGAGATG  >  minE/306785‑306855

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑