Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 313675 314054 380 73 [0] [0] 184 acrA multidrug efflux system

Only 100 of 184 total aligned reads displayed.

CCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATG  >  minE/314055‑314126
|                                                                       
ccGCCAGAGGCGTAATCCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:781831/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCatat                                      >  1:105765/1‑36 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTaaa                                 >  1:232030/1‑41 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGGGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:836314/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGAt                  >  1:667371/1‑56 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:414756/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:601619/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:560825/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:545816/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:540666/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:517880/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:486790/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:472919/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:467550/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:460150/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:45492/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:437177/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:638305/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:410728/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:402305/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:380688/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:380633/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:358756/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:350202/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:300056/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:268226/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:267442/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:821112/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:981139/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:929902/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:893649/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:885598/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:880737/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:87968/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:850270/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:845631/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:838616/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:828498/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:618404/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:763783/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:737509/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:733941/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:73293/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:7027/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:688928/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:672629/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:667240/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:101130/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:631478/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1163056/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1355946/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1344721/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1314218/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1288281/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1265904/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1245503/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1236183/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1215007/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1212633/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1203198/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1190750/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:253286/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1162272/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1155994/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1144908/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1115827/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1093188/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1090243/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1082331/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1074704/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1041000/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:102907/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1011016/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1384855/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:263686/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:240262/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:229230/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:21934/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:180732/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:179323/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1557945/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1556256/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1543975/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:136063/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1507847/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1500927/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1490727/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1433666/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1515087/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1394761/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaa    >  1:282554/1‑70 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaa    >  1:219361/1‑70 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtc      >  1:873948/1‑68 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATgggtcaat   >  1:775308/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTAAAATtggtcaat   >  1:1560900/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGAGTCCGATTTCAAATtggacaat   >  1:209381/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGTAAACCCTCTATTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1327186/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGT‑AACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaatg  >  1:995425/1‑71 (MQ=255)
ccGCCAGAGGCGT‑AACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1513134/1‑70 (MQ=255)
ccGCCAAAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATtggtcaat   >  1:1400/1‑71 (MQ=255)
|                                                                       
CCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATG  >  minE/314055‑314126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑