Missing coverage evidence...
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GATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTG  >  minE/348974‑349044 |                                                                       gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:23911/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:997237/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:923450/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:887679/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:871554/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:763901/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:740330/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:714063/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:69294/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:68341/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:66389/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:495814/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:449814/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:425083/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:305702/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1010030/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:226626/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1472614/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1452287/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1425267/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1342935/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1339197/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1299135/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1298031/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1280901/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1103456/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1096342/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1063805/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTg  <  1:1040780/71‑1 (MQ=255) gATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATATCTGGCGACTTTg  <  1:1328591/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GATTCCGGCTGCGCTAGGGGTTTGTGCCGCTGATCCGAAACGCAATGTGGTGGCGATTTCTGGCGACTTTG  >  minE/348974‑349044

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑