Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	558462	558486	25	35 [0]	[0] 47	iaaA/cmr	L‑asparaginase/multidrug efflux system protein

TGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTG  >  minE/558487‑558531 |                                             tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:651914/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:21519/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:410814/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:425937/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:441529/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:4827/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:486115/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:487949/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:523196/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:527913/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:543362/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:609103/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:207818/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:66258/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:673011/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:779934/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:7952/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:804053/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:825460/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:847572/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:903490/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:90968/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:975324/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:177385/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:11278/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1144335/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:115455/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1197271/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1214160/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1216144/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1254573/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1274827/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1339562/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1371398/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1391373/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1400164/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1468019/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1479145/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1500525/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1504792/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1516268/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1522761/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1552550/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:162455/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1019636/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGCCAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:1031101/45‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGGGAGCCAATACAGACAAGTCGTTGAGAATAAAGTg  <  1:443293/45‑1 (MQ=255) |                                             TGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTG  >  minE/558487‑558531

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑