Missing coverage evidence...
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GGAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGT  >  minE/583301‑583371 |                                                                       ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGGGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1384388/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:695840/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:303667/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:348607/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:36514/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:476740/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:556317/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:578585/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:594816/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:638497/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:228277/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:706694/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:79594/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:8132/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:822440/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:867329/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:898177/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:909440/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:91057/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1300146/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1063938/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:112384/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:11624/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1162520/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1164275/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1191839/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1214465/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1258282/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:228388/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1301835/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:149665/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1506285/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1539168/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:170621/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:174342/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:204629/71‑1 (MQ=255) ggAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGt  <  1:1021687/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GGAGCGGTGAGATAAACGATGGGCGTTACCTGACGCGAAAAATTCCTTATCGGCAGCGGGGTAATGAGCGT  >  minE/583301‑583371

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑