Missing coverage evidence...
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TTGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATC  >  minE/702583‑702625 |                                           ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:732252/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:318495/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:356564/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:448640/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:554772/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:702324/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:711726/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:717182/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:724523/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:303926/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:757039/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:761158/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:761575/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:776785/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:810550/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:839610/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:847884/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:904788/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1541838/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1090853/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1111979/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1262176/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1277045/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1330701/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1469713/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1481580/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:1077699/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:182310/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:225470/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:241802/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:247128/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:258175/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:289892/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:293024/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:298199/43‑1 (MQ=255) ttGGATAGAGCTGGTATTAGCGTGACAGCATTTGTCCACCATc  <  1:116196/43‑1 (MQ=255) |                                           TTGGATAGAGCTGGTATTTGCGTGACAGCATTTGTCCACCATC  >  minE/702583‑702625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑