Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	842024	842049	26	49 [0]	[0] 87	rssB	response regulator of RpoS

CTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCT  >  minE/842050‑842120 |                                                                       cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCtgat                                      >  1:568436/1‑35 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCGCGAATGAACGGGCt  >  1:1111181/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGc   >  1:1374816/1‑70 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:476931/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:552517/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:528905/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:521301/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:514040/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:512611/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:511369/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:509548/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:497318/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:480066/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:588857/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:47657/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:43817/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:419201/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:402110/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:355202/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:35136/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:336797/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:224344/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:208083/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:741411/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:99460/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:936593/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:926050/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:91115/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:830790/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:829604/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:798046/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:760043/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:744351/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:185617/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:734008/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:72282/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:708245/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:696241/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:677826/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:660015/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:655676/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:617764/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:596481/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1162322/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1020765/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1268546/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1263404/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1257024/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1252740/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1243740/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1241525/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1239212/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1211201/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1172999/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1294244/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1160354/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1158093/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1148174/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1140807/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1119981/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1116300/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1064167/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1055002/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1023142/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1314688/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:161886/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:161335/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:160880/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:159644/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:159143/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1547167/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1538092/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1532790/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1513346/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1483815/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1468355/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:142360/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:142045/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1403604/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1381021/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1332625/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:1322415/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:12954/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATAAGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:846182/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACATGATGATATGTGat                            >  1:193799/1‑45 (MQ=255) cTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGAACTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCt  >  1:795307/1‑71 (MQ=255) cTTGAGTAGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAAAGGGCt  >  1:137545/1‑71 (MQ=255) |                                                                       CTTGAGTTGCTGGGAGGTTTCACTCCAGACCTGATGATATGTGATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCT  >  minE/842050‑842120

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑