Missing coverage evidence...
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TATGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATAA  >  minE/853171‑853227 |                                                         tatGGCGACCGACAAGATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1201761/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:713001/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:523460/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:531535/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:536225/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:55771/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:59069/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:613993/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:623195/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:659898/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:668010/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:679797/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:487848/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:804444/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:807127/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:844209/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:874527/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:884928/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:902690/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:933336/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:983591/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:999542/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:14957/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1049288/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:112087/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1175579/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1229720/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1256453/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1263500/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1294308/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1471163/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1491192/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:503282/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:283562/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:284139/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:320246/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:321156/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:377822/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:427128/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:436376/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:458773/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1039762/57‑1 (MQ=255) tatGGCGACCGACAACATTGGTGGGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATaa  <  1:1444923/57‑1 (MQ=255) |                                                         TATGGCGACCGACAACATTGGTGTGGAATTACTGGCAGCGACGCCGTTCCGCCATAA  >  minE/853171‑853227

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑