Missing coverage evidence...
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GGCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCG  >  minE/879935‑880004 |                                                                      ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTa                                   >  1:301863/1‑37 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTAc                                  >  1:1484506/1‑38 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCagtgag                           >  1:314960/1‑45 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:1337387/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:376829/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:1490331/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:435500/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:770939/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:1148127/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcc   >  1:1112503/1‑69 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGcag  >  1:135975/1‑68 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:993498/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:830273/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:94511/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:874519/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:385033/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:393066/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:404896/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:849629/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:55944/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:569651/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:225779/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:748947/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:838581/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:785005/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1187714/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1024509/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1060034/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1066694/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1084468/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1154691/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1173146/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1181758/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:352647/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1189240/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1430047/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1451520/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1459860/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1510824/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:210642/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:1001637/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCg  >  1:290782/1‑70 (MQ=255) ggCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGCCTACCagtgagt                          >  1:939044/1‑46 (MQ=255) |                                                                      GGCGCGCTGCAACAGTTGCTACAAATCTACCAGGCTACCAGTGAGTGGCAGAAAGCAATTGATGTTGCCG  >  minE/879935‑880004

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑