Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	17886	18024	139	139 [0]	[1] 90	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

TGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTC  >  minE/18023‑18093   |                                                                     cgTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:184842/70‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCTTGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1229342/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:56065/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:582125/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:558244/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:555971/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:532427/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:527147/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:525017/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:507883/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:496699/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:494054/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:479008/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:466599/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:459389/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:454313/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:452702/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:427509/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:391725/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:386807/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:368556/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:364492/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:362261/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:299036/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:821419/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:983095/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:981842/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:906997/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:87636/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:870003/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:866840/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:85600/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:851797/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:836135/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:830302/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:296508/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:811197/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:728950/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:726929/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:719708/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:674192/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:655248/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:647862/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:634348/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:607062/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:599344/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1205290/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1347323/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1019843/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1342869/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1327719/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1303443/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1285662/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1283019/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1248871/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1245520/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1235530/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1344840/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1188228/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1162109/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:113480/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1122272/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1100581/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1099249/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1086716/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1056992/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1023870/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1481404/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:248422/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:235084/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:207117/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1553454/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1544831/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1522522/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1519579/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1501297/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1500430/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1489896/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1379466/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1455244/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1453366/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1451911/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1450068/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1429839/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:141798/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:140498/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1386482/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCACGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:107258/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACAATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:688086/69‑1 (MQ=255)   tCGTAGAAATTGCTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTc  <  1:1259525/69‑1 (MQ=255)   |                                                                     TGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTC  >  minE/18023‑18093

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑