Missing coverage evidence...
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CGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGACAA  >  minE/899105‑899173 |                                                                     cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCATTGCCGGacaa  <  1:998254/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:290936/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:967572/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:955919/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:926548/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:86382/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:818647/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:59120/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:558890/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:47242/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:417822/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:319360/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:301442/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1017728/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:242268/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:240616/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:240124/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:216517/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:187211/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1385446/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1308335/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1306514/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1276351/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1062193/69‑1 (MQ=255) cGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGacaa  <  1:1019590/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CGGTCTGGCGCTGTTTACCCTGGTTGCTTACATCATTTTGTCATTTGCGCTTGATCCAATGCCGGACAA  >  minE/899105‑899173

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑