Missing coverage evidence...
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GCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCA  >  minE/900483‑900553 |                                                                       gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:601910/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:172806/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:244462/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:299414/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:307008/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:313667/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:391115/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:462408/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:491716/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1542648/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:604822/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:611181/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:638523/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:676667/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:748516/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:825416/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:881285/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:901893/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1323523/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1090108/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1111174/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1115910/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1145159/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1198175/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:119990/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1281022/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1306003/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1073580/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:133641/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1346944/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1356969/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1385543/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1422994/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1478135/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:148079/71‑1 (MQ=255) gCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCa  <  1:1518558/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GCGGGGGAGTGGCAGGATATTCAGCAACTCGGTGAATGCAGTCATTTAATGTTTGATTTTGTCTGCAACCA  >  minE/900483‑900553

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑