Missing coverage evidence...
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GATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCG  >  minE/942920‑942995      |                                                                       gATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:961003/71‑1 (MQ=255) gATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:960709/71‑1 (MQ=255) gATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:1209565/71‑1 (MQ=255) gATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:572423/71‑1 (MQ=255)  aTGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:518183/70‑1 (MQ=255)  aTGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:1396390/70‑1 (MQ=255)  aTGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTg       <  1:1324800/70‑1 (MQ=255)      aCTTCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1313589/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCGGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1458239/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCtttt                  >  1:1410394/1‑55 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTc   >  1:1265334/1‑70 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:782977/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:777043/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:73759/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:693579/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:673073/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:566797/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1518812/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:285793/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:158713/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1560626/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1021234/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1392485/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1385853/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1374313/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1099814/1‑71 (MQ=255)      aCTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCg  >  1:1049851/1‑71 (MQ=255)      |                                                                       GATGTACTGCCCGTGGCTCGGTTGCAGCATACCCATTAAAAGCTGTGCGAGGGTGCTTTTGCCGCAGCCTGACTCG  >  minE/942920‑942995

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑