Missing coverage evidence...
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CAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCT  >  minE/972013‑972083 |                                                                       cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGGATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:460969/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCGTGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:1174389/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:487753/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:889616/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:746373/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:720613/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:67026/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:662558/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:634181/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:578558/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:494266/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:404429/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:26986/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:22067/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:1500352/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:1322954/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:128884/71‑1 (MQ=255) cAGATCGATAGCGTACAGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTct  <  1:1189688/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCT  >  minE/972013‑972083

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑