Missing coverage evidence...
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TCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATT  >  minE/972193‑972230 |                                      tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:1149583/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:1158407/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:1559878/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:175886/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:263480/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:341749/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:696620/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:811676/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAtt  >  1:916755/1‑37 (MQ=255) tCGTCAGGT‑AAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTAt   >  1:719797/1‑36 (MQ=255) |                                      TCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATT  >  minE/972193‑972230

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑