Missing coverage evidence...
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GGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAAT  >  minE/991462‑991532 |                                                                       ggCGTCGGGTTTATTTCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCggg                        >  1:156013/1‑49 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTggg                                      >  1:1546902/1‑35 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCa                               >  1:319305/1‑42 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTa                  >  1:794174/1‑55 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTa                  >  1:173925/1‑55 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaat  >  1:1039081/1‑71 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaat  >  1:1365904/1‑71 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaat  >  1:1432404/1‑71 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaat  >  1:144642/1‑71 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaat  >  1:184123/1‑71 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:842873/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:81771/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:784131/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:779010/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:716866/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:381983/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:1523954/1‑70 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcga    >  1:235476/1‑69 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcga    >  1:1101505/1‑69 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcga    >  1:1024289/1‑69 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcga    >  1:1012573/1‑69 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTACCTgaataga    >  1:1475735/1‑69 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATAGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTgaatcgaa   >  1:11046/1‑70 (MQ=255) |                                                                       GGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAAT  >  minE/991462‑991532

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑