Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1053518	1053609	92	22 [0]	[0] 100	ydhL	conserved hypothetical protein

ACTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTTTGCTTG  >  minE/1053610‑1053680 |                                                                       aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTTATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:577504/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:4666/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:631452/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:616305/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:612722/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:6088/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:588630/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:578037/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:571573/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:541712/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:515270/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:511372/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:487672/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:633261/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:459012/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:417687/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:405241/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:404539/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:401262/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:382878/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:346361/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:331912/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:327948/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:326386/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:324212/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:791097/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:992605/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:974252/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:971442/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:937692/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:931821/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:909584/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:903418/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:868165/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:864789/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:846064/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:829073/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:322102/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:781296/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:776024/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:767071/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:764595/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:74515/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:736761/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:718407/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:708949/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:6524/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:649422/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:635470/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:119481/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1353110/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:133981/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1337438/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1332811/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1327835/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1314046/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1310128/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1308769/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:129669/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1252741/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1225986/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1224543/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1406420/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1188770/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1174496/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:116668/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1158155/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1153469/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1146602/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1142502/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:112725/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1118048/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1065413/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1048399/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1416265/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:300429/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:29705/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:262463/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:249585/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:239920/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:238577/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:217409/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:181819/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:176172/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:172372/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:167000/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:165644/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:154134/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1537486/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1493120/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1466331/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1456709/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1456518/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1451951/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1439849/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:143718/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1428464/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:304104/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCAATATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:97639/71‑1 (MQ=255) aCTTCGCCATCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTttgcttg  <  1:1026374/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ACTTCGCCCTCCTCAGATAAGATTATTACCATTATTGAAGCTGTTAATGTCCAAAGTAGCAACTTTGCTTG  >  minE/1053610‑1053680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑