Missing coverage evidence...
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TGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGC  >  minE/1098047‑1098094 |                                                tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:48843/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:985904/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:958689/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:835489/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:814281/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:785991/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:707982/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:706547/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:687169/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:582659/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:573774/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:550147/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1021771/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:37949/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:235713/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1409415/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1356940/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1220569/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1219079/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1142511/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1130469/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1098874/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1061697/48‑1 (MQ=255) tGCCTACTATTAGCGCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGc  <  1:1378444/48‑1 (MQ=255) |                                                TGCCTACTATTAGCTCACGGTTATAAATCAACATATTGATTTATAAGC  >  minE/1098047‑1098094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑