Missing coverage evidence...
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TACATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAT  >  minE/1172578‑1172639 |                                                              taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCaaaaa                          >  1:37367/1‑38 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:387462/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:98724/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:87854/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:865562/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:794947/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:787286/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:750702/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:698942/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:623061/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:586182/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:527996/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:512365/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:104227/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:348848/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:320549/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1552643/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1533362/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1463073/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1443020/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1415796/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1356890/1‑62 (MQ=255) taCATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAt  >  1:1116543/1‑62 (MQ=255) |                                                              TACATACTTTAGAGGCGATAATTTTATCCATGCAAAAAAAATATCCAACGAATTTTCTTGAT  >  minE/1172578‑1172639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑