Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1189522	1189682	161	76 [0]	[0] 41	yeaJ	predicted diguanylate cyclase

ATGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGA  >  minE/1189683‑1189752 |                                                                      aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:526832/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1001958/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:269952/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:315947/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:348917/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:42791/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:433887/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:44294/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:499416/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:513760/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:176203/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:538029/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:568623/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:681267/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:769796/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:79956/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:836817/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:889985/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:9222/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:975987/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1240061/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1126700/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1138402/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1158771/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1163720/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:118980/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:120350/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1228438/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:123127/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1234271/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:166141/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1376584/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1423558/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1426717/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1441687/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1477782/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1538057/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1554850/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:1561833/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAATAACCGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:63037/70‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACTTTGCGATGAAATACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGa  <  1:482814/70‑1 (MQ=255) |                                                                      ATGTTGAATACTTTGCGATGAATAACTGGTCCTTCCTGCAGTCAGGAAGTATTGGCATCGATCGCAAAGA  >  minE/1189683‑1189752

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑