Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207258	1207547	290	25 [0]	[0] 84	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

TCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATG  >  minE/1207548‑1207618 |                                                                       tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATg                                   >  1:246827/1‑38 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATg                                   >  1:411879/1‑38 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGtt                                >  1:471684/1‑41 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGt                                 >  1:1322558/1‑40 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATc                             >  1:520187/1‑44 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAAc                          >  1:1118774/1‑47 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTgg            >  1:1110282/1‑61 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGc           >  1:588011/1‑62 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTAc        >  1:262734/1‑65 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTgct   >  1:952349/1‑68 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:357601/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:657408/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:1365934/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:1333079/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:1288702/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:872653/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:1153188/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:923245/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGAt   >  1:1071228/1‑70 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:69596/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:526443/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:532838/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:524388/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:535451/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:524064/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:555757/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:523723/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:571993/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:503621/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:590083/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:76032/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:981904/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:972781/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:936841/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:918001/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:901133/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:888458/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:806457/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:787783/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:602527/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:714479/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:711877/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:700721/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:407848/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:693921/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:686712/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:675681/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:646170/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1181796/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1451713/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1394053/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1380849/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1323633/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1267727/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:125398/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:123899/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1215227/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1461823/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1168277/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1122508/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1114383/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1111380/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1038182/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1031881/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1010855/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1009502/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:289564/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:462435/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:455398/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:439865/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:439782/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:1008980/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:394887/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:346291/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:293325/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:467506/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:280919/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:262138/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:259193/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:226657/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:222859/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:158932/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATg  >  1:157082/1‑71 (MQ=255) tCGCCGGTGGCATGATCGT‑GTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTgg            >  1:173837/1‑60 (MQ=255) |                                                                       TCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGGTTATCAACATGATGCGTGCTGGCTACCTGATG  >  minE/1207548‑1207618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑