Missing coverage evidence...
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TTACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCAA  >  minE/1220254‑1220314 |                                                             ttACCTACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:747381/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTGTCATCaa  <  1:165305/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:423112/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:372208/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:446175/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:472044/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:543522/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:610337/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:658686/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:728907/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:760251/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:780771/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:789100/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:891690/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:910051/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:929595/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:939167/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:978540/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1420083/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1054220/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1055473/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1057440/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:110044/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1231733/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1254655/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1341800/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1043827/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:1423854/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:164303/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:223597/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:223882/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:292152/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:293955/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:303963/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:338752/61‑1 (MQ=255) ttACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCAGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCaa  <  1:770553/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTACCAACGTTGCCCGCAATGTGACATGCTGTTTAGCCTGCCCGAGATAAATTCTCATCAA  >  minE/1220254‑1220314

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑