Missing coverage evidence...
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GATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGC  >  minE/1245662‑1245732 |                                                                       gATCCAACGTTCCCATACGCACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:168610/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCACCGCCCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:761406/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGAc                     >  1:1512492/1‑52 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTgg   >  1:339850/1‑70 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:902164/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1045539/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:793404/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:631926/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:567386/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:539026/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:520351/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:435256/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:431463/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:404451/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:401121/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:311764/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:264404/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1448449/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1423609/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1365250/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1316168/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1309648/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1160774/1‑71 (MQ=255) gATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGc  >  1:1074018/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGC  >  minE/1245662‑1245732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑