Missing coverage evidence...
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TAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAA  >  minE/1272784‑1272830 |                                               tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCTGCGAAATGTTCaa  >  1:371776/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTTaa  >  1:825526/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:467852/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:328709/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:340989/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:358839/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:384525/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:400212/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:448260/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:450140/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:323511/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:54620/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:572349/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:629576/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:773289/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:818566/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:888504/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:916737/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1272808/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1020226/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1032665/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1064893/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1123799/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1142295/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1165798/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1244802/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1005983/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1356920/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1436160/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1460080/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1507593/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1537187/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:1560265/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCaa  >  1:300351/1‑47 (MQ=255) tAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCC‑GCGAAATGTTCaa  >  1:1201808/1‑46 (MQ=255) |                                               TAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAA  >  minE/1272784‑1272830

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑