Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1339856	1340598	743	146 [0]	[0] 68	wcaC	predicted glycosyl transferase

CGCACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAA  >  minE/1340599‑1340669 |                                                                       cgcgcgCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGGCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:396033/71‑1 (MQ=255) cgcATGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1421380/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaat  <  1:356782/71‑2 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:456054/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:6020/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:556347/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:525481/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:519636/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:487658/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:476658/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:475295/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:607191/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:406569/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:3871/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:384516/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:35259/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:316863/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:906129/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:980956/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:967471/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:966642/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:946559/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:937411/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:91479/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:914535/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:912493/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:309676/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:894758/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:876786/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:833375/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:787501/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:774198/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:709771/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:690826/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1124706/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1315007/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1273542/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1266189/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1230184/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1212278/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1169758/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1136397/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1129007/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:246907/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1096872/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1082790/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1078076/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1072004/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1057666/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1054051/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1034487/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1498076/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1030926/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:218783/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:216834/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:214340/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:209301/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:197619/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1538800/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:150599/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1474598/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1461417/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1431757/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1429325/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1375792/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:134951/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:1318832/71‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCAGCCAGTCGCACATTAAATTGCaaaa  <  1:642205/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CGCACGCTGGTGGAGATCTAACGCCACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAA  >  minE/1340599‑1340669

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑