Missing coverage evidence...
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TTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATC  >  minE/1378737‑1378807 |                                                                       ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTAt   >  1:961118/1‑70 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTAt   >  1:589837/1‑70 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:497787/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:906120/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:885430/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:872714/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:849949/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:763653/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:754099/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:728063/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:69883/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:697490/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:640522/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:551250/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:516050/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1014744/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:484049/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:478571/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:449696/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:368415/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:367049/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1442449/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1382062/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1380138/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1258946/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1203323/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1202070/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1099846/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:1032911/1‑71 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCAACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTACAGTTTTGATGCCTTTATc  >  1:36183/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATC  >  minE/1378737‑1378807

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑