Missing coverage evidence...
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CAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCA  >  minE/1431093‑1431162 |                                                                      cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGata                         >  1:1066664/1‑47 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGc   >  1:772465/1‑69 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:468000/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:990711/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:967338/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:947930/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:879035/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:763592/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:755510/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:577927/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:565006/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:420398/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:388192/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:331704/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:1545402/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:1230996/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:1215901/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:1147971/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCa  >  1:1104957/1‑70 (MQ=255) cAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTCTCAAAGAt     >  1:1460381/1‑67 (MQ=255) |                                                                      CAAATAAACCGCATAATTAATAAGCCATTTTTATAGCCGCTAAGATATTAAAGGATGTGTCAAAGATGCA  >  minE/1431093‑1431162

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑