Missing coverage evidence...
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CCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTC  >  minE/1452567‑1452637 |                                                                       ccgccTCCGCCGCGAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1544188/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:477615/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:187558/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:190306/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:21641/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:256092/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:289658/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:428538/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:474774/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1543023/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:654207/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:677450/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:729439/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:754468/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:762742/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:809283/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:913018/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1323655/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:113902/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1165461/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1198925/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1228674/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1237195/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1261195/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1294363/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1101850/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1350524/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1352677/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:140150/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1413885/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1457689/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1471008/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1487107/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:1517441/71‑1 (MQ=255) ccgccTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCAGGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtc  <  1:851683/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCCGTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTC  >  minE/1452567‑1452637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑