Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1560877 1561029 153 23 [0] [0] 16 evgS hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

TCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCT  >  minE/1561030‑1561100
|                                                                      
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1004244/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1171796/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1261971/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1339785/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:141169/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:149498/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1552324/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:213079/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:280468/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:525378/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:630231/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:753645/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:76269/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:832487/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:882995/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:901022/71‑1 (MQ=255)
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TCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCT  >  minE/1561030‑1561100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: