Missing coverage evidence...
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CACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCA  >  minE/1642056‑1642126 |                                                                       cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:668342/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:454133/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:482640/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:5058/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:50780/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:513920/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:523137/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:530224/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:575498/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:633308/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:636226/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:44649/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:690317/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:694156/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:702538/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:71111/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:715536/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:776622/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:781252/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:799692/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:904934/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:934348/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1404863/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1104877/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1134712/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1140682/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1224095/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1239081/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1291940/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1334120/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1343988/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1364750/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1374425/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1047978/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:1449355/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:210987/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:240520/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:270339/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:325671/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:327426/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:32877/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:335744/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:367289/71‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCa  <  1:40612/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCA  >  minE/1642056‑1642126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑