Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	87314	87503	190	129 [0]	[0] 47	ddlB	D‑Alanine:D‑alanine ligase

TTGATTGAAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGA  >  minE/87504‑87546 |                                           ttgattgaAAAATGGCTAAGTTGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:192428/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGt       >  1:1138490/1‑38 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTTCGa  >  1:1544761/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCg   >  1:286845/1‑42 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCg   >  1:180909/1‑42 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:597505/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:285527/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:291507/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:300655/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:319878/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:49582/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:563919/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:584309/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:596591/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:983074/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:696648/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:703755/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:717191/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:781247/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:840790/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:842632/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:874720/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:877060/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:961973/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:963160/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1001980/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1334558/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1029064/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1072841/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1117367/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1122408/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1139799/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1167159/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1177921/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1206224/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1297879/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1326997/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:266906/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1365978/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1426752/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:143914/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1473623/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1478202/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:1528639/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:184157/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:187163/1‑43 (MQ=255) ttgattgaAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGa  >  1:227344/1‑43 (MQ=255) |                                           TTGATTGAAAAATGGCTAAGTGGGCCGGAGTTCACGGTTGCGA  >  minE/87504‑87546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑