Missing coverage evidence...
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GGATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGCT  >  minE/1731510‑1731553 |                                            ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:824055/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:375480/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:386057/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:445309/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:456776/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:515154/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:673928/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:725541/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:809767/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:371147/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:829815/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:844455/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:846085/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:850194/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:875116/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:915685/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:971262/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:97871/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1292953/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1110042/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1121836/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1191817/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:123717/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1247907/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1256943/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1291180/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1292738/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1059382/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1298572/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1359017/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1370758/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1444377/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:1544360/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:207312/44‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGct  <  1:246969/44‑1 (MQ=255) |                                            GGATTATCTGCTGCTACAACCTGATACGGCGCGCCATTTAAGCT  >  minE/1731510‑1731553

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑