Missing coverage evidence...
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CACAATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAG  >  minE/1767600‑1767670 |                                                                       cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:490818/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:242507/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:331745/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:343893/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:377716/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:387884/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:442293/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:464778/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:484012/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:236898/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:556479/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:665513/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:716395/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:804733/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:879352/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:942844/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:950180/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:978142/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:235904/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1043564/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1091026/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1260922/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:126804/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1281250/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1285240/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1295259/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:129773/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1301884/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1314367/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1322113/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:133822/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1344537/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:234525/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:10100/71‑1 (MQ=255) cacaATGGGCACCGAGGTTGAGGGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAg  <  1:1018125/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CACAATGGGCACCGAGGTTGAGTGAGTCATACGGGGGCAAGCTCACGCCGCCGATACGAGTGGAGCTACAG  >  minE/1767600‑1767670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑