Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1916902	1917065	164	95 [0]	[0] 32	mutH	methyl‑directed mismatch repair protein

TACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAT  >  minE/1917066‑1917116 |                                                   tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGc              >  1:755650/1‑39 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTcg          >  1:773881/1‑43 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTg     >  1:1214028/1‑48 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:103822/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:690045/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:167964/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:776985/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:1293961/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:943420/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGa   >  1:1075258/1‑50 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:824443/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:761451/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:102232/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:715471/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:695948/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:690941/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:960732/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:685605/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:562858/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:53077/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:50462/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:485890/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:396248/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:341010/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:318769/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:297481/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1516310/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1422666/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1294605/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1222587/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1221567/1‑51 (MQ=255) tACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAt  >  1:1181127/1‑51 (MQ=255) |                                                   TACCGGTTGAAGGCGAGCGCAGCATCCCGCTGGCGCAGCGTCGCGTTGGAT  >  minE/1917066‑1917116

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑