Missing coverage evidence...
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ACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTA  >  minE/1948442‑1948509 |                                                                    acacTGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:549547/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:431686/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:968284/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:92649/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:925463/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:834071/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:827586/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:717646/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:698828/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:671859/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:616463/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:565539/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:50784/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:48961/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:477458/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:475643/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:109667/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:429246/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:393796/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:236939/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1506036/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1453869/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1450396/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1432312/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1419783/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1419011/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:120248/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1195100/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1188793/68‑1 (MQ=255) aCAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1150462/68‑1 (MQ=255) aCAATGCCTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTa  <  1:1400763/68‑1 (MQ=255) |                                                                    ACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTA  >  minE/1948442‑1948509

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑